海口國家高新區創業孵化中心位于南海大道266號，海口國家高新區藥谷二期中心服務區內，項目總用地面積為39733.11m2,分二期建設，一期建設工程為研發A樓1棟（占地面積2328.66 m2,建筑面積18043.17 m2,）；二期工程擬建設研發B樓、C樓各1棟、綜合樓1棟。高新 區科技企業孵化器位于研發A樓的3-5層（建筑面積約6000平米），于2014年5月底正式掛牌。
2014年8月，高新區管委會正式組建孵化器管理運營有限公司，作為孵化器的日常管理和運營機構。同時，高新區出臺了《孵化器企業（項目）入 駐管理暫行辦法》和《孵化器種子資金管理暫行辦法》，初步構建管理政策體系；逐步完善了會議室、食堂等硬件設施和配套服務設施，為企業的正常運作提供全面保障。目前，已入孵企業22家，涉及領域包括新能源新材料、電子信息和生物醫藥等領域。